Duda Editando Tema de WordPress y Rendimiento BD - CPU

[pleter]

si colocas el footer y header en el index.php no fuerzas la base de datos porque hace las mismas consultas sql... y por ende es lo mismo.
lo que si, evitas hacer 2 includes php (uno al footer y otro al header)
eso si... no creo que eso te de una "optimizacion" apreciable o que se pueda considerar, como para que valga la pena tener todo en un mismo archivo, a futuro es mas facil editar el footer por separado y que se modifiquen todos que entrar a modificar uno por uno en cada lugar que lo colocaste.