¿Como estas tratando de hacer esto?
Ok tienes una matriz de dos dimensiones y en cada posición me imagino que esta la representación de un color en RGB (Red, Green, Blue (Rojo, Verde, Azul)).
Si es hacia solo te falta, poner tal información en la pantalla, en pygame sería mas sencillo por que puedes dibujar pixeles de manera sencilla. Pero en Tkinter no te permite tal acción, si no quieres que crear rectángulos de 1x1 y tratar eso como un pixel.
Hechale un vistazo a
este modulo Edito: Lo mas aconsejable es que uses
PIL