Por políticas de actualización, segumiento de errores, cantidad de usuarios y soporte (formal e informal), creo que para un servidor es mejor Red Hat. Al menos por acá es lejos la más popular y eso te ahorra un montón de tiempo (no tienes que resolver problemas que otros ya han resuelto por ti
).
Ahora, si tienes tiempo como para hacer las cosas "a mano", quizás te convendría usar Debian o sus derivados.
Por mi parte, Red Hat es lejos la opción que me ofrece la mejor relación esfuerzo-resultado. Y además es muy bonita
(Ni yo me entendí esta última parte, pero qué le vamos a hacer)