Hola:
La verdad es que no urgo mucho sobre ese tema, pero no tengo dudas de que ese tipo de enlace no es adecuado... fíjate con que facilidad puedes resolver tu duda:
Código:
<a href="seccion.htm" onclick="cargar('seccion.htm'); return false"></a>
seccion.htm seguro que se indexará correctamente, pero el enlace se cancela con "return false", y solo se ejecutará el script... aunque tal vez debas retocar algo más...
Saludos