Hola.
Cual es tu problema??
1) no puedes hacer las operaciones para calcular dichos valores?
2) no sabes que usar para generar el pdf?
3) tu problema es de bd?
1.- investiga que porcentaje se aplicara de i.v.a. y realiza una regla de tres.
2.- con respecto al pdf
http://www.fpdf.org/
con javascript no creo que puedas generar el pdf, tendria que ser con un lenguaje del lado del servidor (para en paso de la libreria que te paso PHP)
3.- si tu problema es la consulta postea tus tablas y te ayudamos.
NOTA: de pendiendo del problema identifica el foro correcto para hacer tu pregunta.
