Cita:
Iniciado por lair 
...verifica la linea 13 del archivo JPGRAPH.PHP y ve como esta llamando el archivo para que lo coloques en el directorio correcto...
ahi vas a encontraralgo como:
require_once("libs/jpgraph.php");
o no se como este exactamente pero esa linea de codigo es la que tienes que hacer coinsidir con tu estructira de directorios.
No tienes que modificar nada en el php.ini, gd simplemente es la libreria para el manejo de imagenes.