Yo soy mas partidarios de aprender haciendo (INICAP) jajajaja, es decir los manuales son un aporte, pero mas se aprende en terreno, por ejemplo te recomiendo que le metas manos al theme twentyten que trae por defecto wordpress o bien comiences analizando algun theme blanco o limpio para wordpress, como por ejemplo wordpress-naked, whiteboard, vanilla, etc. El que te recomiendo es wordpress-naked, es mas simple de dijerir.
y esta sera tu biblia de ahora en adelante
http://codex.wordpress.org/Function_Reference/
saludos.