Para que Tomcat no modifique el archivo
mod_jk.conf que ya debes haber creado, se debe deshabilitar la autogeneración de configuración de Tomcat...
Para lo cual se debe modificar el archivo server.xml,
comentándose las líneas que hacen referencia "org.apache.jk.config.ApacheConfig"
Código:
<!--
<Listener className="org.apache.jk.config.ApacheConfig"
....
/>
-->
Edita el archivo agregando al archivo
mod_jk.conf la línea:
justo antes de la línea de la directiva de cierre
</VirtualHost>
Reinicia Tomcat y luego reinicia Apache.