Bueno, no se que tan familiarizado estás con WP
Lo que necesitas es definir un clásico LOOP
http://codex.wordpress.org/The_Loop
Y recuerda decirle a WP que muestre X (multiplos de 3) posts por página ( 9, 12, 15, etc)
Para paginar puedes usar WP Page Navi (Es un plugin muy bueno y configurable)