Hola:
Si tu página solo tiene el index, supongo que tan solo te debe preocupar que indexen bien ese index... pero si hay contenidos que no son accesibles desde el index, aunque se mal-indexen, no serán accesibles para los que no habiliten javascript...
Si te preocupa la indexación usando Ajax, también deberías preocuparte por usar bien Ajax... por ejemplo, si hay un contenido que se carga con la función entrar y el parámetro "casa"... podrías a la vez de tener en la página algo así:
function entrar(donde) {
switch (donde) {
case "casa":
buscar_Ajax(entrando, "casa")
}
}
Y el enlace:
?accion=entrar¶metro=casa
Espero que te sirva.
Saludos