Sería algo así:
Código:
public static void main(String[] args) {
int contadorAmarillo = 0;
int contadorVerde = 0;
int contadorAzul = 0;
for (int i = 0; i < args.length; i++){
if (args[i].equals("amarillo"){
contadorAmarillo ++;
continue;
}
if (args[i].equals("verde"){
contadorVerde ++;
continue;
}
if (args[i].equals("azul"){
contadorAzul ++;
continue;
}
}
// Imprime lo que quieras a partir de aquí, usando los contadores.
}
Espero que esto te valga, un saludo!