damascosolutions:
te sugiero que cambies tu sistema para insertar Flash, eso de los comentarios condicionales está obsoleto.
te dejo una demo
http://foros.emprear.com/flash/flash-xhtml.html
Revisa el código fuente
el
data="tuflasfh.swf" y el
param name="movie" value="tuflash.swf"
son los parámetros minimos requeridos, los otros, segun tus necesidades
Saludos