Duda Select.. Where vs Inner Join

[JonathanB]

Saludos compañeros, hoy los quisiera molestar a que me ayudaran a entender el siguiente query.

Tomar en cuenta lo siguiente:
BASE_A tiene 788669 registros y BASE_B tiene 1721

Código SQL:

SELECT TOP 1000
        BASE_A.CUENTA,
        BASE_A.NOMBRE
        BASE_A.FECHA_EXP
FROM BASE_A, BASE_B
WHERE   BASE_A.CUENTA = BASE_B.CUENTA AND
        BASE_B.ESTADO < 3 OR
        BASE_B.ESTADO > 4 AND
        BASE_A.MONTO  > 0
 

Tiempo: 5 seg

VS

Código SQL:

SELECT DISTINCT TOP 1000
        BASE_A.CUENTA,
        BASE_A.NOMBRE
        BASE_A.FECHA_EXP
FROM BASE_A
INNER JOIN BASE_B
ON      BASE_A.CUENTA = BASE_B.CUENTA AND
        BASE_B.ESTADO < 3 OR
        BASE_B.ESTADO > 4 AND
WHERE   BASE_A.MONTO  > 0
 

Tiempo: 0 seg (lo muestra inmediatamente)

Mis dudas son las siguientes:

• De que manera realiza la consulta el Inner Join para que pueda mostrar la información inmediatamente.
  
• Porque necesito usar Distinct en el query de Inner Join.
  
• Y la última seria, en que casos se recomienda realmente usar Join vs un simple Select Where.

Muchas gracias por su ayuda