Con un poco de la ayuda de Panino y deshaciéndome del botón de Facebook y haciéndolo yo mismo ya consigo cerrar el popup. Ahora lo que quiero es que la redirección que me hace ese popup sea en una ventana nueva, no que me pise la ventana padre. Lo más que consigo es eso mismo haciéndolo de la siguiente manera:
<a href="#" onclick="javascript
:window.opener.location.href='h ttp://loquesea.html';window.close();" >Enlace</a>
Quiero que al abrirlo no me pise la ventana padre.
Muchas gracias!!