Muchas gracias por el consejo, lo he instalado y configurado, marcando las opciones pertinentes, mis enlaces de etiquetas son de la siguiente manera ahora:
<a href="http://www.futbolgol.es/tag/milan" rel="tag">Milán</a>, <a href="http://www.futbolgol.es/tag/real-madrid" rel="tag">Real Madrid</a>
¿No debería de salir la etiqueta nofollow en el rel?, no se si he conseguido lo que quería con esto.
Edito: Lo que ha hecho es añadirme en las páginas que no quiero que indexe lo siguiente:
<meta name="robots" content="noindex,follow" />