me tinca que es por las comillas como tienes declara la consulta ??
si la empiezas con comillas dobles los string tienes que cambiarlos por comillas simples
Código PHP:
SELECT
organizaciones.id as organizacionId,
organizaciones.organizacion,
sectores.sector,
giros.giro,
tamanos.tamano
FROM organizaciones
JOIN
giros
on
organizaciones.giro_id=giros.id
JOIN
sectores
on
organizaciones.sector_id=sectores.id
JOIN
tamanos
on
organizaciones.tamano_id=tamanos.id
WHERE
organizaciones.organizacion LIKE('%%') OR
sectores.sector LIKE('%%') OR
giros.giro LIKE('%%') OR
tamanos.tamano LIKE('%%') ORDER BY organizacion desc