Puedes hacer una función que te de el path absoluto al root del proyecto así,
para un archivo que se ejecuta en
http://localhost/pepe/doc/head.php
este script:
Código PHP:
<?php
$path = $_SERVER['PHP_SELF'];
$temp = explode("/", $path);
$path_absoluto = "";
for($i=1;$i<count($temp);$i++)
$path_absoluto .= "../";
$path_absoluto .= "head.php";
echo "<h3>$path_absoluto</h3>";
?>
te devuelve:
../../../head.php
Así puedes hacer un include sabiendo siempre la ruta que debes recorrer.
No sé si te entendí, creo que lo que intentas es incluír archivos php que están en una ruta absoluta. Prueba esto a ver si te sirve, saludos