Hola:
Lo que pasa es que no lo tienes definido en línea... prueba así:
Código:
<p><a href="#" onclick="mostrarcapa('capauno')">Mostrar-Ocultar div uno</a></p>
<div id="capauno" style="display: none">Contenido de div uno</div>
<p><a href="#" onclick="mostrarcapa('capados')">Mostrar-Ocultar div dos</a></p>
<div id="capados" style="display: none">Contenido de div dos</div>
<div>
Saludos
