hoy en día los navegadores bloquean todo popup que venga provocado básicamente de los eventos onload, es decir, los "automáticos" debido a lo molestos que son, obviamente si provienen de un onclick no se bloquearán.
también existen las alternativas de los
lightbox, que no es más que un truco de capas para emular una popup modal, pero es la mejor opción que tienes contra los auto popups
