Da igual, puedes colocarlo en el archivo.js o en la propia página entre etiquetas script DIFERENTES a en las que llamas al archivo.js. Es decir, si decides ponerlo en la página sería así:
Código HTML:
Ver original<script type='text/javascript'> var numeroImage = 43 ;
function img(){
var numeroAl = Math.floor(Math.random() * numeroImage ) + 1;
document.write('
<img src="./irudiak/' + numeroAl + '.jpg">');
}
setInterval('img()', 1000);
Saludos (: