java -jar nombre.jar
Indicando la ruta si no estás en el directorio adecuado.
Recuerda que al crear el jar tienes que indicarle la clase que lleva el main para que pueda ejecutarse (Main Class).
http://www.cs.princeton.edu/introcs/...n/jar/jar.html
Incluso podrías ejecutarlo con dobleclick (sin bat) si tienes el JRE instalado.