Es sencillo, vamos a imaginar que hiciste esta tabla, e ingresaste estos valores
Código MySQL:
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--
-- Dumping data for table `foo.bar`
--
(1, 'foo'),
(2, 'bar');
Cuando vayas a hacer un select necesitas hacerlo de esta forma
Si lo haces `foo.foo.bar` te traerá un error de que tabla no existe. Porque la forma de indicarle a mysql que es un indicador es encerrar todo aquello con el backtick y separar con el punto para indicarle a mysql qué es la base de datos y qué es la tabla (siguendo las reglas de sintaxis). Porque en el indicador tú le puedes poner el caracter de punto (aunque no lo recomiendo) como parte del nombre.