Hace tiempo yo busque lo mismo y no encontre nada que me convenciera así que desistí...
Ahora viendo tu post me he puesto a buscar por google y he encontrado esto:
Comparar imagenes con PHP
No se si te será útil, ni que limitaciones tendrá pués no lo he probado. Pero para conseguir comparar imagenes sin pedir mucho, puede valer.
Saludos,
