Cita:
Iniciado por Boehda 
Todos los enlaces a los que me refiero son enlaces internos a otras secciones de mi pagina.
Lo que queria saber era si para los robots seria mas o menos igual ver el script (el resultado de el: una imagen con un link interno) que ver en html una imagen con un link.
Deberias de utilizar enlaces sin la necesidad de incluir javascript, ya que los enlaces internos no tienen gran importancia si los comparamos con enlaces externos, pero ayudan a que Google se de cuenta de la estructura de la pagina web y posicionas mejor.