Vale, gracias.
Voy a probar con ini_set y lo comento en el foro si funciona bien o no.
Código PHP:
<?php
ini_set('post_max_size','200M');
ini_set('upload_max_filesize','200M');
ini_set('max_execution_time','100000');
ini_set('max_input_time','100000');
// script de upload
?>
Un saludo