Hola:
Hace poco tuvimos un desafío sobre transiciones entre 2 imágenes (un tema que está marcado como importante), y al menos mi solución se basaba en capas con las imágenes como fondo de las mismas... creo que si en vez de aplicar las transiciones a las imágenes (tag img), las aplicas a capas con imágenes de fondo, se soluciona tu problema.
Saludos