Tu pregunta es un poco ambigua. Aclarame un detalle. Lo que deseas es:
[CSS]
.mivariable{background:#999}
Y asignar esa clase a un div, una tabla, el body, o lo que lo requiera, o...
[CSS]
$mivariable = #999;
body{background:$mivariable}
div.clase1{background:$mivariable}
tabla.clase1{background:$mivariable}
El segundo caso es también posible con un PHP que genera un CSS (Aunque no exactamente como el ejemplo, pero similar). Muchos páginas como los blogs hacen esto para que el usuario modifique facilmente los colores de la página y estos se almacenan en variables.
Si es lo segundo, puedo conseguirte el código fácilmente, solo debo encontrarlo entre mis carpetas. Tu avísame que necesitas y así te ayudamos. Suerte