Si desde Ajax se puede llamar a funciones PHP, que no lo sé si se puede, sería cuestión de "disparar" la función en vez del archivo, así ya no necesitarías "script.php" y lo tendrías todo en "padre.php"
Curioseando por internet... igual con la librería "
Xajax" solucionas algo (de hecho creo que hace exactamente lo que tu quieres, llamar a funciones php ;), echale un vistazo al
tutorial )...
De todas formas, si dices lo que quieres hacer, igual vemos un método alternativo.
Saludos.