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Iniciado por emprear 
Como tenes hecho el buscador? con php, extrae términos de una Base de datos, creas un índice, dame mas datos por favor. en principio no veo problema en que la página de resultados generada salga con un encabezado iso-8859-1
saludos
Es un buscador totalmente externo, no sé cómo se lo monta, pero lo hace tódo él mismo: atomz