Estoy de acuerdo (hace unos minutos estaba leyendo sobre el tema en el artículo que indiqué, para repasar el concepto), lo único (me corrigen si me equivoco), es que en ciertos lenguajes es más cómodo trabajar con UTF-8 que con latin-1, por ejemplo XML (también para la versión 6 de PHP por defecto la salida será en UTF-8).
Lo que sí es, como tú dices, lo que hace especial a UTF-8 es, y cito:
Cita:
Iniciado por http://www.phpwact.org/php/i18n/charsets#why_utf-8 ...en primer lugar, que es una codificación de Unicode y, en segundo lugar, que es compatible con ASCII.
Habría que verificar hacia qué codificación estarán usando por defecto los lenguajes y empezar a adaptarse a esa codificación.