php se ejecuta en el servidor, no tiene nada que ver con el javascript que se ejecuta en el navegador del cliente, ni mucho menos jQuery.
el código que tienes
solo borra la fila de la tabla del HTML y como se ejecuta en el cliente, php no interviene para nada, lo que necesitas hacer después del $(this).remove()
es enviar por medio de AJAX el id del registro para que php ejecute la consulta SQL DELETE de eliminación en la base de datos
las tablas HTML
son tu interfaz, pero no están ligadas a las tablas de tu base de datos