no uso el CuteFTP Lite, pero si trae opciones de edición y es un archivo .html, si seria fácil cambiar el texto o las imágenes, teniendo en cuenta que para editar un archivo .html basta con el bloc de notas
.
ahora para cambiar imágenes, simplemente reemplazarías la imagen actual con la nueva, en caso quieras editar las imágenes me parece que hay webs que te permiten hacer eso en linea.
para cambiar la estructura del sitio, pues si el FTP te permite editar texto también te permitiría editar el código, pero para esto tendrías que saber que modificar, dependiendo de si usas tablas, div, css...
pero si tienes acceso a los archivos mediante FTP, porque no descargarlos, modificarlos en tu maquina, hacer las pruebas necesarias y luego volverlos a subir.
si dieras mayores datos, por ahí la web que quieres modificar para tener una idea mas clara de lo que necesitas, podrías recibir ayuda mas precisa.