Exacto fgil2...el cliente es quien decide.
debrosio,
Una de las formas que podrías es utilizar un ActiveX para facilitarle (haciendo que el cliente solo elija Si o No) para abrir la aplicación. Y si es dentro de una Intranet, en IE por ejemplo, podrías colocar ese sitio o página donde se encuentre la aplicación en los "trust sites".
Te invito a que veas este hilo:
http://www.forosdelweb.com/showthrea...hreadid=109255