Buenas,
1- Creas el archivo php con el UPDATE correspondiente. Para cuando se ejecute ese archivo actualize los campos a 0.
2- Utilizando Cron Job haces que a las 12 de la noche, se ejecute dicho archivo.
Cuestión: ¿Como utilizo Cron Job?
Aquí (Aunque puede depender del Panel que tengas...)
Saludos,