La mejor manera es mediante css, usando margin-right, por ejemplo. Sería algo así:
Código HTML:
<ul id="menu">
<li><a href="#">Enlace Uno</a></li>
<li><a href="#">Enlace Dos</a></li>
<li><a href="#">Enlace Tres</a></li>
</ul>
El CSS que podrías usar:
Código:
#menu {
list-style: none;
}
#menu li {
display: inline;
margin-right:5em;
}