Básicamente las aplicaciones de escritorio en java se suelen desarrollar con alguna interfaz de usuario, y las típicas son awt, swt y swing, con lo que podrías buscar aplicaciones específicas.
¿En otro caso, estarías buscando algo como lo que aparece aquí?
http://sourceforge.net/search/?type_...5D=trove%3A198
ejemplo (
http://jsmooth.sourceforge.net/ )