Supongo que en main.css estaran todos los estilos de la pagina... sin afectar el menu, que esos estan por separado en imagemenu.css
Que es exactamente lo que no funciona? Que navegador estas usando para probar?... te recomiendo Firefox, en la consola de errores puedes ver que es lo que pasa.
Por ultimo, phatfusion usa mootools, hay otra version para jquery que a mi me funciona muy bien:
jQuery.imageMenu