Crear Crontab desde PHP

[Nemutagk]

Es la peor manera de realizar lo que quieres, eso funcionaria si tubieras 3, 5, 10 usuarios, pero que tal si ese numero sube y ya son 5000 o 10000 usuarios?, te has puesto a pensar que sucedería? ahora, desde PHP es dificil, a menos que este tenga permisos de super usuario (que en un hosting normal no tendrá) por lo cual no podrás hacerlo de manera dinámica

Lo que mejor puedes hacer es marcar una campo de la ultima fecha de actividad del usuario, si pasa 3 meses borrarlo, todo esto SIN utilizar cron