Hola.
primero que nada necesitas usar multicell, no se si lo hagas y para fpdf el salto de linea es \n y no <br>
Cita: Este método permite imprimir texto con saltos de línea. Estos pueden ser automáticos (tan pronto como el texto alcanza el borde derecho de la celda) o explícito (via el carácter \n). Tantas celdas como sean necesarias son creadas, uno debajo de otra.
Ve a la pagina de la libreria:
http://www.fpdf.org/
suerte.