Bueno, he probado algunas de las opciones que me han propuesto, y el problema más especifico lo resolví de la siguiente manera:
document.write("<td width='14%' align='center'><a href=javascript
:MostrarConsulta('consulta.asp?tcc= <%=tcc%>&fecha="+matriz[fila][0]+"&resto="+obtiene_mes1()+"&cve=<%=idusuario%>' ); return false>"+matriz[fila][0]+"</a><p> </p></td>")
dado que no anteponía "
javascript:" no me mandaba llmar la función... Gracias de nuevo...