sí podrás descargar la web, pero sólo obtendrás el (X)HTML, Javascript y CSS, porque la parte de PHP al ejecutarse en el servidor (tal cual dice @DeFFeR) solo devuelve eso, no te devolverá el código php.
En cambio si tienes conocimiento de que dicha web uso como base algún software prefabricado, como Joomla, Wordpress, phpBB, podrás descargar el código php de éstos, pero aún así no tendrías certeza de si en dicha web fueron previamente adaptados a sus necesidades, por el cual quedarías en lo mismo
