Hola joseisrael
en qué momento llamas a la popup?
Tal y como muestra tu código en ningún momento estás llamando a la función que abre la ventana pop-up. Simplemente le pides un target="popup" y el navegador cuando no conoce un target simplemente lo "arroja" en una ventana nueva (_blank).
Obviamente no es una ventana abierta mediante javascript por lo que no existe una opener.
prueba con algo así:
<FORM METHOD=POST ACTION="pepe.php" NAME="formulario"
onSubmit="Start('')" TARGET="popup">
