Si usas una Clase para el manejo de la base de datos, puedes hacer un metodo que te ejecute un sql y cada vez que llames a este metodo creas o escribes en un archivo la sentencia sql q pasaste como parametro al metodo anterior, es decir:
Código PHP:
public function ejecutarSQL($sql){
$f = fopen('log.txt','a+');
write($f,'\r\n'.$sql.'\r\n');
fclose($f);
}