Lo de las dos particiones de 12 Gb, si, esa es la razón. En Windows Diskpart te muestra la extendida como "Partición 0" y la lógica como "Partición 3".
Esto te ayudará a aclararte.
IMO si ya tienes el disco original W7 y los drivers, la partición de recuperación no tiene caso. El formateo del disco lo puedes hacer desde el live cd de ubuntu o seguramente al instalar W7.
Saludos