Hola de nuevo,
claro, es que antes al llamar directo al swf directamente te ocupaba toda la ventana (frame) y en cambio ahora se mostrará a las dimensiones de la movie.
Cambiale los valores de width y height a 100%
Nugar, creo recordar que efectivamente netscape no acepta o aceptaba la transparencia en los fondos de los swf, de eso hace yá un tiempo, lo que no sé es si la versión actual de netscape la soporta o sigue sin hacerlo
Un saludo