En el momento en que cambia algo en una url Google lo considera como una nueva url, a pesar de que solamente ha cambiado la extensión. Incluso cambiar una_url_cualquiera.htm a una_url_cualquiera.html hace que lo considera como una nueva página.
Tendrás que hacer un
301 redirect con .htaccess.
Es lo que Google mismo recomienda para no perder posiciones en sus resultados.