Claro que no!!!!, deberia cargar todo el contenido correctamente, tu problema puede ser que la pagina que cargues ya no deberia tener head ni body si no el codigo que este en el body directamente.
Ademas que la direccion de las imagenes y los estilos ya deberian ser relativas a donde el documento principal y no al lugar en donde esta guardado el archivo.
Ejemplo:
Suponiendo que tu index esta en la raiz del sitio:
index.html
Y el archivo que llamas desde el index se encuentra en:
carpeta1/hola.html
Y en tu archivo hola.html estas llamando a una imagen que se encuentra en:
/carpeta1/img/imagen1.jpg
Lo mas seguro es que en este momento lo estes llamando asi:
<img src="img/imagen1.jpg">
Pero si lo llamas asi no te funcionara, pues ahora ese hola.html interpreta como si se encontrara en la raiz, por lo que para llamar a la misma imagen deberias hacerlo asi:
<img src="carpeta1/img/imagen1.jpg">
El mismo razonamiento bedes usar para cualquier otra llamada (imagenes, css, js, etc.) tomar como partida el lugar donde se encuentra tu html principal.
Saludos.