ayuda con confirm

[sargoman]

Primero que todo les saludos como primer post y espero poder ser de ayuda para algunos y que me puedan ayudar esta ves

Pasa lo siguiente

Tengo que hacer un confirm en c# y pasa que cuando lo coloco en mi codigo este lo lee y todo pero el codigo sigue corriendo y no se detiene a esperar la respuesta.

Me explico mejor con un ejemplo.

int contador1 = obtieneContador(parametro);
int contador2 = obtieneContador(parametro);

if(contador1<contador2){
//Page.ClientScript.RegisterClientScriptBlock(this.G etType(), "ALGO", "javascript:PreguntaTopeHorario('no puede hacer esto, \\r ¿Continúa? ');", true);

continua el codigo
}

el tema es que lo ideal es que al responder que si continue pero al ejecutarlo continua igual y nunca sale el confirm ni nada y el codigo se ejecuta

Mi idea es detener de algun modo el codigo cuando requiera la respuesta, capturarla y continuar dependiendo de esta

Se me entiende????
Alguien sabe o tiene algun codigo que me sirva???

Ojo que no es un evento generado por el click de un boton asi que no me sirve por lo que se la siguiente linea

boton.Attributes.Add("onclick", "if (!confirm('¿ Está seguro que desea aceptar esta información ?')) return false;");

de ante manos se agradece
y como dije antes espero ser un aporte a este foro igualmente