La diferencia es que los divs tienen la posición por defecto (static) y los otros tiene posición absoluta, lo mejor es usar los normales ya que la posición absoluta no es necesaria en la mayoría de los casos, y como al parece puedes posicionar contenidos con medidas en px se descuadra todo en resoluciones diferentes.
Pero eso son solo cosas del Dreamweaver te recomiendo que empieces a ver cosas obre HTMl y CSS.
Saludos