Puedes hacerlo como dice nuestro amigo
shakaran. Liberalo bajo una licencia y punto, de hecho sería la mejor opción.
Pero luego aparte de eso tenemos herramientas que lo que hacen es codificar todo el código fuente, de tal manera que es como si estuviera oculto.
Para ello puedes encontrar herramientas como
ionCube, aunque es de pago, pero es extremadamente bueno.
Si buscas algo gratuito es cuestión de buscar.
Info GPL
Saludos,